耶路撒冷问题是以色列与阿拉伯国家多年对抗的关键。

耶路撒冷问题是指耶路撒冷的主权和归属问题，是巴以关系中最为棘手的问题。对于巴勒斯坦人来说，耶路撒冷是伊斯兰教先知穆罕默德由麦加夜行到此登霄的地方，是伊斯兰教的第三圣地。而犹太人则称早在公元前１０世纪，他们的祖先大卫王就建立了以耶路撒冷为首都的“以色列王国”，因而耶城应归他们所有。

大约在公元前３０００年，迦南人耶布斯部族从阿拉伯半岛迁来，定居于此。相传在耶布斯的王和祭司麦基洗德在位时，建造耶路撒冷城，意即和平之城。

“金色”耶路撒冷的几乎所有房屋和殿堂都是用淡黄色的“耶路撒冷石”建成的。这里曾修建过第一和第二圣殿，后毁于战火，第二圣殿现仅残存一段西墙，这就是著名的“哭墙”。传说伊斯兰教创始人穆罕默德在他５２岁时的一个夜晚，随天使由麦加来到耶路撒冷，踩着一块岩石升上了七重天，接受天启，黎明赶回麦加。这次神奇的“夜行和登霄”记载在《古兰经》中。犹太教、基督教和伊斯兰教都根据各自的传说将耶路撒冷奉为圣地。三大宗教的信徒为争夺对耶路撒冷的控制权多年来一直相互残杀。

从１５１７年到第一次世界大战之前，耶路撒冷处于奥斯曼帝国的统治之下。１９２２年由英国“委任统治”。１９４７年，联合国大会通过巴勒斯坦“分治”决议，规定耶路撒冷归联合国管理，耶路撒冷实际上具有了“特殊国际地位”，但因几个月后以色列发动战争，这一决议实际上成了一纸空文。

１９４８年５月第一次阿以战争爆发后，以色列侵占耶路撒冷城西区，并在１９５０年宣布耶路撒冷为首都。城东区由约旦控制。１９６７年第三次阿以战争时，以色列进而占领全城。１９８０年７月，以色列议会通过法案，将耶路撒冷定为以色列“永恒和不可分割的首都”。此举引起阿拉伯世界和国际社会的强烈谴责。

几乎所有以色列人在保持耶路撒冷统一问题上的立场都是一致的。几个世纪以来，犹太人在告别时说的一句话都是：“明年在耶路撒冷见！”

在以色列，宗教圣地对所有人都是开放的。犹太人可以在“哭墙”下哭泣哀祷，基督徒可以在殿堂祈祷，穆斯林（出于安全考虑，对巴勒斯坦人有限制）可以不受限制地进入清真寺。以色列人准备在对耶路撒冷东部部分地区的主权上作出让步，但绝不会自动让出该城市的一半。根据他们的信仰，他们准备在该市修建第三座永久圣殿。

巴勒斯坦民族权力机构主席阿拉法特强调，没有巴勒斯坦对东耶路撒冷行使全部主权，就没有巴以和约。巴勒斯坦方面要求，以色列应根据联合国安理会２４２号决议将耶路撒冷同其他西岸地区一起归还巴勒斯坦，但是以色列方面表示，以只同意归还西岸和加沙９４％－９５％的土地，以换取以色列继续对东耶路撒冷拥有主权。

耶路撒冷位于约旦河西岸巴勒斯坦中部，面积１７６平方公里，人口６５万。全城由旧城（东城）和新城（西城）两部分组成。旧城多宗教古迹，是巴勒斯坦人主要居住区。新城是在１９世纪后逐渐建设起来的，主要是犹太人的居住区。

耶路撒冷是一座具有５０００年历史的城市。历史上，不同的民族，包括犹太人、亚述人、罗马人和阿拉伯人等，带着他们不同的宗教信仰都曾先后经过了一次又一次的征战、厮杀而占据这里。由于不同民族、不同文化在这里经过长期的撞击和融汇，耶路撒冷这座古城呈现出你中有我、我中有你的历史风貌，成了犹太教、基督教和伊斯兰教的圣地。

１９世纪初，犹太复国主义兴起，居住在世界各地的犹太人纷纷涌向巴勒斯坦。第一次世界大战后,巴勒斯坦成为英国的托管地，耶路撒冷是巴勒斯坦托管地的首府。后来，英国由于无法控制巴勒斯坦局势，宣布从巴勒斯坦撤走其军队，并将这一问题提交联合国。１９４７年１１月，联大通过了有关巴勒斯坦分治决议的第１８１号决议，规定在巴勒斯坦建立犹太人的国家和阿拉伯人的国家，耶路撒冷国际化，由联合国管理。

１９４８年，第一次中东战争爆发，耶路撒冷被分为以色列辖区（西耶路撒冷）和阿拉伯即约旦辖区（东耶路撒冷）。１９５０年，以色列自行宣布耶城为其首都。在１９６７年的“六·五战争”中，以色列占领了包括东耶路撒冷在内的大片阿拉伯领土，并于１９８０年７月宣布合并后的耶路撒冷为其永久的首都。此外，自１９６７年占领全部耶路撒冷以来，以色列历届政府采取耶路撒冷犹太化的政策，在耶路撒冷的东、南、北三个方向的巴勒斯坦土地上修建了一连串定居点，并力图把这些“卫星城镇”并入耶路撒冷，以改变耶路撒冷的人口结构。

面对以色列的侵略和对其领土的不断蚕食，巴勒斯坦人从１９６５年起走上了独立开展武装斗争的道路。１９８８年１１月１５日，巴勒斯坦全国委员会第１９次特别会议通过了《独立宣言》，宣告成立以耶路撒冷为首都的巴勒斯坦国。九十年代初，巴勒斯坦人在国际社会各方力量的斡旋下，开始了与以色列和谈的历程。

１９９３年，巴以双方在华盛顿签署的第一个和平协议规定，耶路撒冷问题将在巴以最后阶段谈判中解决，此前任何一方均不得采取单方面的行动改变现状。１９９９年９月，巴以双方在埃及签署的《沙姆沙伊赫备忘录》也规定，双方将在今年２月就耶路撒冷地位等棘手问题达成框架协议，９月达成永久性和平协议。